Cartera de Serveis
Oferim suport integral en bioinformàtica per als grups de recerca de l’IRIS-CC i per a altres institucions col·laboradores, des de la infraestructura computacional fins a l’anàlisi avançada i la transferència de coneixement.
1) Infraestructura computacional
- Disseny i manteniment d’una infraestructura robusta, escalable i optimitzada per a anàlisis bioinformàtiques complexes.
- Suport tècnic per a l’ús eficient de recursos computacionals i l’emmagatzematge segur de dades òmiques.
2) Serveis de clúster (HPC)
- Suport per a execució de pipelines en entorns de clúster.
- Orientació en enviament de feines (jobs), monitoratge i optimització de recursos.
- Acompanyament per a ús d’infraestructures compartides i bones pràctiques de computació científica.
- Enllaç d’interès: HPC UVic.
3) Desenvolupament i implementació de pipelines
- Implementació de pipelines i eines de darrera generació per al processament, l’anàlisi i la visualització de dades òmiques (genòmiques, transcriptòmiques, proteòmiques, metabolòmiques, etc.).
- Adaptació i optimització d’eines per a conjunts de dades públics o interns segons les necessitats de cada projecte.
4) Anàlisi i identificació de biomarcadors
- Aplicació de tècniques bioinformàtiques avançades per identificar i validar biomarcadors associats al diagnòstic, pronòstic i tractament de malalties.
- Integració de dades experimentals i públiques per reforçar la robustesa dels resultats.
5) Modelització i integració de dades òmiques
- Desenvolupament de models computacionals per integrar múltiples capes de dades òmiques.
- Aplicació de tècniques d’aprenentatge automàtic i intel·ligència artificial per impulsar la medicina personalitzada i predictiva.
6) Anàlisi estructural i funcional de proteïnes
- Estudi de l’estructura i la dinàmica de proteïnes per comprendre’n la funció biològica i el paper en processos patològics.
- Avaluació de l’efecte de mutacions a nivell proteic (predicció d’estabilitat, canvis conformacionals i impacte funcional).
- Anàlisi d’interaccions proteïna-proteïna i identificació de possibles punts d’intervenció terapèutica.
- Integració d’informació estructural amb dades òmiques per contextualitzar els efectes moleculars de les alteracions genètiques.
7) Recerca col·laborativa
- Col·laboració activa amb els grups de recerca de l’IRIS-CC per potenciar l’ús de mètodes computacionals avançats en l’anàlisi, la visualització i la interpretació de dades biomèdiques.
- Col·laboració amb altres entitats i instituts de recerca, com en projectes multi-òmiques compartits.
- Assessorament científic i tècnic en el disseny d’estudis bioinformàtics i projectes multidisciplinaris.
- Equip de bioinformàtics qualificats per donar resposta a necessitats diverses d’anàlisi de dades òmiques i estructurals.
- Resolució de problemes específics i personalització d’enfocaments segons el tipus de dades i els objectius del projecte.
- Formació específica en diferents àmbits de la bioinformàtica.
- Coordinació d’una xarxa interna per fomentar el coneixement compartit, la col·laboració interdisciplinària i l’optimització de recursos.
- Organització d’una activitat anual d’actualització en bioinformàtica.
- Promoció de bones pràctiques en la gestió, l’anàlisi i la integració de dades biomèdiques.